SimBiology模型构建器

交互式构建QSP、PK/PD和机械系统生物学模型

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描述

的SimBiology模型构建器app允许您交互式地构建动态系统模型，如定量系统药理学(QSP)模型、药代动力学/药效学(PK/PD)模型和系统生物学模型。它提供了一个框图编辑器，通过使用内置块来构建模型反应示意图。

使用该应用程序，您可以:

构建代谢网络、信号通路、QSP模型、PBPK模型、PK/PD模型等多种动态系统。
从内置库创建标准隔间PK模型。
将模型视为图形表示或数学方程。
使用变量来存储一组不同于基本模型配置的参数值或初始条件。
创建一个剂量数组，以探索不同的给药方案。
从MATLAB中导入或导出SimBiology模型^®工作空间或从系统生物学标记语言(SBML)文件。

打开SimBiology Model Builder App

MATLAB工具条:在应用程序选项卡,在计算生物学，点击应用程序图标。
MATLAB命令提示符:输入simBiologyModelBuilder．

例子

编程使用

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`simBiologyModelBuilder`

simBiologyModelBuilder打开应用程序。

`simBiologyModelBuilder (m1）`

simBiologyModelBuilder (m1）打开SimBiology模型m1在SimBiology模型构建器如果你也有SimBiology模型分析器应用程序同时打开，两个应用程序共享相同的模式。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析器App已经打开，不能从命令行加载模型或项目。直接从应用程序加载模型。

`simBiologyModelBuilder (prjFile）`

simBiologyModelBuilder (prjFile）打开项目文件prjFile在SimBiology模型构建器应用程序。prjFile是一个字符串或字符向量，指定SimBiology项目SBPROJ文件的文件名或路径和文件名。如果仅指定文件名，则该文件必须位于MATLAB搜索路径或当前文件夹中。如果你也有SimBiology模型分析器应用程序同时打开，两个应用程序共享同一个项目。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析器App已经打开，不能从命令行加载模型或项目。直接从应用程序加载模型。