SimBiology®는계량시스템약리학(QSP)생리학기반약물동태학(PBPK)약동학/약력학(PK / PD)응용분야에중점을두고동적시스템을모델링,시뮬레이션및분석하는앱및프로그래밍툴을제공합니다。SimBiology블록다이어그램편집기를사용하여대화형방식으로,또는MATLAB®언어를사용하여프로그래밍방식으로모델을구축할수있습니다。백지상태에서부터모델을생성하거나,用포맷파일로가져오거나,SimBiology에서제공하는예제를기반으로하여모델을구축할수있습니다。
SimBiology는다양한복잡성과규모의상미분방정식기(ODE)반모델을분석하는다양한기법을제공합니다。시뮬레이션을통해목표실현가능성을평가하고,약효와안전성을예측하며최적투여일정을식별할수있습니다。지역및전역민감도분석을사용하여주요경로및파라미터를식별하고,파라미터스윕을통해지역생물학적변이를평가할수있습니다。파라미터를추정하려면비선형회귀및비선형혼합효과기법을사용하여데이터를피팅하고비구획분석(NCA)을수행할수있습니다。
시작하기:
SimBiology커뮤니티
SimBiology및MATLAB을사용한QSP, PBPK및PK / PD모델링작업을수행하는과학자커뮤니티입니다。
모델 구축
SimBiology模型构建器를사용하여계량시스템약리학(qsp),생리학기반약물동태학(pbpk)또는약동학/약력학(pk / pd)모델을종이위에그리는것처럼구축할수있습니다。
모델역학지정
드래그앤드롭방식의블록다이어그램편집기또는프로그래밍툴을사용하여QSP, PBPK또는PK / PD모델을구축할수있습니다。用(系统生物学标记语言)파일에서기존모델을가져옵니다。
모델변형체생성
모델변형체를사용하여기본모델의구성과다른일련의파라미터값또는초기조건을저장할수있습니다。모델에대한여러개의사본을생성하지않고도가상환자,약제후보,대체시나리오및가상(假设)가설을쉽게시뮬레이션할수있습니다。
垫子약전략평가
垫子약전략을정의하고평가할수있습니다。다른모델종류를대상으로한투약일정을결합하여복합치료의이점을평가하고최적의투약전략을결정할수있습니다。
모델시뮬레이션
SimBiology模型分析또는프로그래밍방식의툴을통해다양한결정론적솔버와확률적솔버를사용하여모델의동적동작을시뮬레이션할수있습니다。
솔버 선택
Matlab ode솔버,日晷솔버등의사용가능한여러결정론적솔버중하나를선택하거나,확률적시뮬레이션알고리즘(SSA)명시적타우리핑,암시적타우리핑등의확률적솔버중하나를선택할수있습니다。
시뮬레이션가속화
모델을컴파일된C코드로변환하여대규모모델의시뮬레이션또는몬테카를로시뮬레이션을가속화할수있습니다。并行计算工具箱™를사용하여여러코어,클러스터또는클라우드컴퓨팅리소스에시뮬레이션을배포하면성능을더욱향상시킬수있습니다。
비구획분석
구획모델을가정하지않고약제농도의시간경로측정값으로부터약제의약물동태학파라미터를계산할수있습니다。희소또는직렬샘플링을사용하여단일또는다중투약에대한실험및시뮬레이션데이터둘다에서NCA를수행할수있습니다。
비선형혼합효과기법(nlme)
확률근사기대값최대화(SAEM), 1차조건부추정(FOCE), 1차추정(FO),선형혼합효과(LME)근사또는제한된LME근사의확률적근사를사용하여모집단데이터를피팅하는NLME방법을사용할수있습니다。
내장프로그램및대화형탐색툴
SimBiology模型分析仪앱의내장분석단계를사용하여분석프로그램을작성할수있습니다。슬라이더를사용하여모델결과에대한파라미터또는투여량일정의변동에따른효과를대화형으로탐색할수있습니다。
지역및전역민감도분석
지역및전역민감도분석을수행하여모델수량변동이모델반응에미치는효과를살펴볼수있습니다。전역민감도분석을사용하여어떤모델입력값이파라미터공간전체의모델응답을유도하는지이해하고파라미터추정전략에반영할수있습니다。
사용자지정분석
SimBiology를MATLAB스크립트와함께사용하여프로그래밍방식으로분석을자동화하고사용자지정분석을생성할수있습니다。커뮤니티에서기여한툴을애드온으로사용하여가상모집단시뮬레이션과같은SimBiology모델에대한사용자지정분석을수행할수도있습니다。
웹앱구축및배포
앱디자이너로앱을만들고MATLAB编译器™로패키징하여MATLAB Web应用服务器™로호스트할수있습니다。협업자는소프트웨어를설치하지않고브라우저에서웹앱에접근하고실행할수있습니다。