SimBiology®提供用于建模、模拟和分析动态系统的应用程序和编程工具,重点关注定量系统药理学(QSP)、基于生理学的药代动力学(PBPK)和药代动力学/药效学(PK/PD)应用。您可以使用SimBiology框图编辑器交互式地构建模型,也可以使用MATLAB编程地构建模型®语言。您的模型可以从头创建,作为SBML格式的文件导入,或者基于SimBiology中提供的模型示例构建。
SimBiology提供了多种技术,用于分析基于ode的模型,其复杂性和大小不等。你可以运行模拟来评估目标的可行性,预测药物疗效和安全性,并确定最佳给药计划。您可以使用局部和全局敏感性分析来识别关键路径和参数,并通过运行参数扫描来评估生物可变性。为了估计参数,可以使用非线性回归和非线性混合效应技术拟合数据,并执行非分区分析(NCA)。
开始:
SimBiology社世界杯预选赛小组名单区
为使用SimBiology和MATLAB进行QSP、PBPK和PK/PD建模工作的科学家提供了一个聚集地。
建筑模型
构造定量系统药理学(QSP)、基于生理的药代动力学(PBPK),或药代动力学/药效学(PK / PD)就像你用SimBiology模型构建器在纸上画出来的一样。
评估剂量策略
定义和评估给药策略。评估联合治疗的好处,并通过结合针对不同模型物种的给药计划来确定最佳给药策略。
模拟模型
使用各种确定性和随机求解器模拟模型的动态行为SimBiology模型分析或编程工具。
选择一个解算器
从几个可用的确定性求解器中选择一个,包括MATLAB解决歌唱和日晷解决者,或选择其中之一随机动力学,包括随机模拟算法(SSA)、显式跳变算法和隐式跳变算法。
加速模拟
通过将模型转换为编译后的C代码,加速大型模型或蒙特卡罗模拟的仿真。通过跨多个核、集群或云计算资源分布模拟,进一步提高性能并行计算工具箱™.
Noncompartmental分析
从药物浓度的时间过程测量计算药物的药代动力学参数,而不假设室室模型。使用稀疏采样或串行采样,对单个或多个剂量的实验和模拟数据进行NCA。
非线性混合效应技术(NLME)
使用NLME方法使用期望最大化随机逼近(SAEM)、一阶条件估计(FOCE)、一阶估计(FO)、线性混合效应(LME)近似或限制性LME近似来拟合人口数据。
内置程序和交互式探索工具
使用内置分析步骤与SimBiology模型分析仪应用程序组成分析程序。使用滑块交互式探索参数或剂量计划的变化对模型结果的影响。
全局和局部敏感性分析
通过执行局部或全局敏感性分析,探索模型数量变化对模型响应的影响。使用全局灵敏度分析来理解哪些模型输入驱动跨参数空间的模型响应,并为参数估计策略提供信息。
自定义分析
使用SimBiology编程与MATLAB脚本自动化分析和创建自定义分析。您还可以使用社区贡献的工具作为附加世界杯预选赛小组名单组件,在SimBiology模型上执行自定义分析,例如虚拟种群模拟。
构建和部署Web应用程序
创建应用程序使用程序设计师,使用MATLAB编译器™打包它们,并使用MATLAB Web应用服务器™.合作者可以使用浏览器访问并运行web应用程序,而无需安装任何软件。