SimBiology

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生物系统模型,模拟和分析

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SimBiology社世界杯预选赛小组名单区

科学家在QSP聚会场所,PBPK和PK / PD模型使用SimBiology和MATLAB。

建筑模型

构造定量系统药理学(QSP),有着生理基础的药代动力学(PBPK),或药代动力学/药效学(PK / PD)模型就像画在一张纸上使用SimBiology模型构建器。

指定模型动力学

使用拖放方块图编辑器或编程工具来构建QSP PBPK或PK / PD模型。导入现有的模型从系统生物学标记语言(用文件。

创建模型变体

使用模型变量来存储一组参数值或初始条件不同于基础模型配置。很容易模拟虚拟病人,药物候选人,备用场景,假设假设没有创建模型的多个副本。

存储值作为模型变量选择数量。

存储值作为模型变量选择数量。

评估剂量策略

定义和评价剂量策略。评估联合疗法的好处,并确定最优计划给药剂量策略相结合,目标不同的模式物种。

模拟模型

模拟模型的动态行为与各种各样的确定性和随机解决者使用SimBiology模型分析或编程工具。

选择一个解算器

选择一个可用的一些确定性动力学,包括MATLAB解决歌唱日晷解决者,或者选择其中的一个随机动力学,包括随机模拟算法(SSA),明确tau-leaping,隐式tau-leaping。

自动化单位转换

选择的单位最适合于您的模型;例如,指定剂量毫克量,药物浓度毫微克/毫升,等离子体在升。单位转换工具转换所有数量在您的模型和数据一致的单位系统。

指定单位,并自动执行单位转换。

指定单位,并自动执行单位转换。

加速模拟

加速模拟大型模型和蒙特卡罗模拟的将模型转换为编译C代码。进一步提高性能分布模拟多个核心,集群,或云计算资源使用并行计算工具箱™

提高性能的模拟,扩大集群和云。

估计参数

估计模型参数,模型拟合实验数据时间进程。计算通过执行noncompartmental PK参数分析(NCA)。

Noncompartmental分析

计算药代动力学参数的一种药物从药物浓度的测量时间进程没有假设区划的模型。实验和模拟数据上执行NCA单个或多个剂量,使用稀疏或连续采样。

AUC计算浓度时间数据所示线性和半对数的鳞片。

AUC计算浓度时间数据所示线性和半对数的鳞片。

非线性回归

估计参数使用本地或全球评估方法和计算置信区间参数和模型预测。适合每一组独立生成类属特异性的估计或同时适合所有组织估计一组值。

高斯参数置信区间的两舱制PK模型。

高斯参数置信区间的两舱制PK模型。

非线性Mixed-Effects技术(NLME)

使用随机使用NLME方法以适应人口数据采用近似(SAEM),一阶条件估计(FOCE),一阶估计(FO),线性mixed-effects (LME)近似,或限制LME近似。

为非线性mixed-effects方法进展的阴谋。

为非线性mixed-effects方法进展的阴谋。

分析模型

进行灵敏度分析、参数扫描和蒙特卡罗模拟探索行为参数和条件的影响模型。

内置的程序和互动探索的工具

组合分析程序使用内置的分析步骤与SimBiology模型分析仪应用。使用滑块交互式地探索参数或剂量时间表的变化对模型的影响结果。

全球和当地的敏感性分析

探索模型数量变化模型响应的影响通过执行本地或全局灵敏度分析。使用全局灵敏度分析来理解哪些模型输入驱动模型响应在参数空间和通知参数估计策略。

自定义分析

用MATLAB脚本编程SimBiology自动化分析和创建自定义分析。您还可以使用社区贡献工具插件执行自世界杯预选赛小组名单定义分析等SimBiology模型虚拟人群仿真。

世界杯预选赛小组名单社区贡献SimBiology工具在线社区。

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部署模型

使用应用程序创建模型探索应用程序设计师用MATLAB编译器和包。与合作者分享SimBiology模拟,没有获得MATLAB和SimBiology,无需暴露建模细节。

构建和部署Web应用程序

创建应用程序使用程序设计师使用MATLAB编译器、包装它们™,主机使用MATLAB™Web应用程序服务器。合作者可以使用浏览器访问和运行web应用程序不需要安装任何软件。

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