BiofilmQ生物膜是一种先进的分析工具,量化细胞内大量三维生物膜社区的属性在空间和时间。它可以处理许多不同种类的3 d生物膜图像,包括flow-chamber生物膜,殖民地在琼脂,薄膜和聚合。

BiofilmQ是基于一个图形用户界面,不需要编程专业知识或先验知识的图像分析。

BiofilmQ有独特的方法来量化生物膜特性在空间和时间:BiofilmQ不需要单个细胞的光学分辨率。相反,BiofilmQ使用不同的分割方法,基于所获得的生物膜biovolume除以基于阈值的三维分割成立方pseudo-cells。每个多维数据集作为一个单一细胞,荧光,建筑,空间,和更多的属性是测量。通过使用这种技术的方法,可以进行生物膜图像血细胞计数(analogious流式细胞术,但空间特性),基于pseudo-cells的量化参数。

BiofilmQ为展示提供了一个强大的分析和绘图功能的数据从每个pseudo-cell立方体。这是有可能的,例如生成生物膜波动曲线记录仪,demographs,并生成flow-cytometry-like数据集,包括人口控制,其中包括不仅是细胞的荧光和结构性能,而且生物膜内的空间属性。

易于使用的分析和可视化功能使您能够生成高质量的数据数据没有任何编程技能。

对于高级用户和编程技能,所有功能完全可用(MATLAB)的批处理大型数据集。