Zeffiro Interface (ZI)，©2018- Sampsa Pursiainen & ZI开发团队，是一个开放源代码包，构成了一个可访问的工具，用于复杂几何中基于多学科有限元(FE)的正反模拟。使用zeffiro_downloader安装ZI。米to allow automatic updates between the local and remote repositories. The installer and then ZI can be obtained on matlab's command line as follows:
urlwrite ('https://tinyurl.com/zeffiro”、“zeffiro_downloader.m”);zeffiro_downloader;
其中URL是该页面的快捷方式:
https://raw.githubusercontent.com/sampsapursiainen/zeffiro_interface/master/zeffiro_downloader.m
有了ZI，如果STL、DAT或ASC (ASCII)文件格式的三角形表面网格可用，就可以为真实的多层几何生成体积有限元网格。可以产生一个合适的表面分割，例如，使用FreeSurfer软件套件(版权©FreeSurfer, 2013)。这样的分割可以从包含一组ASCII文件的文件夹中立即导入。可以在存储库中找到一个示例文件夹。ZI还允许导入使用FreeSurfer创建的包，以区分不同的大脑区域，从而分析时间序列中大脑功能的连通性。不同的脑区可以被定义为活动的，从而可以分析皮层下结构。在每个隔室中，活动的方向可以是正常受限的，也可以是不受限的。在配备图形计算单元(GPU)的计算机中，ZI的主要程序可以显著加速。尤其值得推荐的是执行前向模拟过程，即使用GPU生成有限元网格、前导场矩阵和在不同点集之间进行插值。经过正演仿真阶段后，也可以在没有GPU加速的情况下处理模型。
界面基本功能的简介可以在这里找到:
https://github.com/sampsapursiainen/zeffiro_interface/wiki
接口本身已经在:
He, Q.， Rezaei, A. & Pursiainen, S.(2019)。电磁脑成像的Zeffiro用户界面:Matlab中用于正反计算的GPU加速FEM工具。Neuroinformatics, doi: 10.1007 / s12021 - 019 - 09436 - 9
近期论文，见:
Galaz Prieto, F.， Rezaei, A.， Samavaki, M.，和Pursiainen, S.(2022)。优化焦距多通道tES刺激中的l1范数vs l2范数拟合:线性和半定规划vs加权最小二乘。生物医学的计算机方法与程序，226,107084，https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2022.107084
Lahtinen, J.， Koulouri, A.， Rezaei, A.， & Pursiainen, S.(2022)。随机多分辨率扫描(RAMUS)在聚焦近场和远场脑电图源定位中的条件指数先验。数学成像与视觉杂志，1-22。
Rezaei, A.， Lahtinen, J.， Neugebauer, F.， Antonakakis, M.， Piastra, m.c .， Koulouri, A.， Wolters, C. H.， & Pursiainen, S.(2021)。使用中位神经SEP数据，通过RAMUS逆源分析技术重建皮层下和皮层体感活动。科学杂志,245,118726。
Rezaei, A.， Koulouri, A.， & Pursiainen, S.(2020)。随机多分辨率扫描的焦点和快速E/MEG感知具有可变深度的大脑活动。脑地形学，33(2)，161-175。
在接口中使用的基本数学技术已经在下面进行了回顾和验证:
Miinalainen, T.， Rezaei, A.， Us, D.， Nüßing, A.， Engwer, C.， Wolters, C. H.， & Pursiainen, S.(2019)。EEG正向问题的一种现实、准确、快速的源建模方法。科学杂志184年56 - 67。
Pursiainen,美国(2012年)。适应于应用EEG和MEG的raviart - thomas型源:实施和结果。逆问题，28(6)，065013。
IAS MAP(迭代交替顺序最大后验)反演方法和分层贝叶斯采样器的基础是:
Calvetti, D.， Hakula, H.， Pursiainen, S.， & Somersalo, E.(2009)。脑源定位的条件高斯超模型。SIAM Journal on Imaging Sciences, 2(3)， 879-909。
它已被应用于一个现实的大脑几何，例如:
Lucka, F.， Pursiainen, S.， Burger, M.， & Wolters, C. H.(2012)。使用现实FE头部模型的EEG逆问题的分层贝叶斯推理:震源初级电流的深度定位和源分离。科学杂志,61(4),1364 - 1382。
当前保持源模型通过基于位置的优化(Position Based Optimization, PBO)方法将线性(面相交)和二次元(沿边)元素结合起来，并使用10源模板，其中对每个包含一个源的四面体元素应用4个面源和6个边缘源:
鲍尔，M.， Pursiainen, S.， Vorwerk, J.， Köstler, H.， &沃尔特斯，C. H.(2015)。基于有限元方法的脑电图正演建模中Whitney (Raviart-Thomas)型源模型的比较研究。《IEEE生物医学工程汇刊》，62(11)，2648-2656。
Pursiainen, S.， Vorwerk, J.， & Wolters, C. H.(2016)。脑电图(EEG)通过H (div)有限元源与焦点插值正演建模。医学与生物物理学，61(24)，8502。
ZI不是为临床应用而设计的。作者不对ZI使用临床数据所获得的结果承担责任。
引用作为
Sampsa Pursiainen(2022)。复杂几何的Zeffiro向前和反向接口GitHub (https://github.com/sampsapursiainen/zeffiro_interface/releases/tag/5.14.7)。检索。
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