-------------------------------------------------------------------------
|<https://github.com/mvallieres/radiomics>|
一个为放射组学分析提供MATLAB编程工具的包。
-------------------------------------------------------------------------
参考:
[1] Vallières, M. et al.(2015)。FDG-PET联合放射组学模型
MRI纹理特征预测软组织肺转移
四肢肉瘤。物理学在医学和生物学,60(14),
5471 - 5496。0031 - 9155/60/14/5471 doi: 10.1088 /
-------------------------------------------------------------------------
作者:马丁Vallières
-------------------------------------------------------------------------
历史:
—1.0版本:2015年5月
-------------------------------------------------------------------------
免责声明:
“我不是程序员,我只是个做事的科学家!”
-------------------------------------------------------------------------
***感谢您对本套餐的兴趣***
如果您对这个包有任何问题、评论或建议,
请不要犹豫与我联系!
此包包含5个文件夹:
1.TextureToolbox:从输入执行纹理分析的MATLAB代码
2D或3D感兴趣区域(ROI)。这个工具箱是独立的
可以在放射组学包之外单独使用。特别是,
这个纹理分析包实现了小波带通滤波,
各向同性重采样,离散化长度修正不同
量化工具。详情请参阅参考文献[1]。
2.'NonTextureFeatures': MATLAB代码,用于计算纹理以外的特征
输入感兴趣的3D区域(ROI)。包括SUV等功能
指标,AUC-CSH,百分比不活跃,大小,固体,体积和偏心。
详情请参阅参考文献[1]。
3.“MultivariableModeling”:MATLAB代码执行多变量分析
逻辑回归、自举、特征集等操作
约简、特征集选择、预测性能估计等。
4.“实用程序”:用于执行不同操作的MATLAB代码,包括
计算SUV地图,读取包含DICOM成像的目录
数据,RTstruct DICOM对象转换为3D掩码等。
5.“研究”:用于特定研究的MATLAB代码。为了重现
某项研究的实验,请参见相应的文件夹。
- 'STSstudy':参考号[1]。影像资料与临床资料是一致的
可在癌症成像档案(TCIA)网站上获得
DOI: <http://dx.doi.org/10.7937/K9/TCIA.2015.7GO2GSKS >.
***************************************************************************
致谢:其他软件代码
-魏的GLRLM工具箱:荀恺魏,灰度运行长度矩阵工具箱
v1.0,软件,北京航空技术研究中心,2007。
<//www.ru-cchi.com/matlabcentral/fileexchange/17482-gray-level-run-length-matrix-toolbox >
- Q. Li: <//www.ru-cchi.com/matlabcentral/fileexchange/23377-ellipsoid-fitting >
- CERR开发团队:<http://www.cerr.info/ >
- Dirk-Jan Kroon (imresize3D.m): <//www.ru-cchi.com/matlabcentral/fileexchange/21451-multimodality-non-rigid-demon-algorithm-image-registration/content//functions/imresize3d.m >
David Reshef和Yakir Reshef: MINE版本1.0.1dhttp://www.exploredata.net/ >
- DREES开发团队:<http://www.cerr.info/drees >
Enric Junqué de Fortuny (fastAUC.cpp): <//www.ru-cchi.com/matlabcentral/fileexchange/41258-faster-roc-auc >
- François Beauducel (roundsd.m): <//www.ru-cchi.com/matlabcentral/fileexchange/26212-round-with-significant-digits >
- Jos van der Geest (herrorbar.m): <//www.ru-cchi.com/matlabcentral/fileexchange/3963-herrorbar >
***************************************************************************
引用
马丁Vallières(2023)。RADIOMICSGitHub (https://github.com/mvallieres/radiomics)。取得済み.
Matlabリリ,スの互換性
プラットフォ,ムの互換性
窗户 macOS Linuxカテゴリ
タグ
謝辞
ヒントを得たファ电子邮箱ル:HERRORBAR,灰度运行长度矩阵工具箱,b样条网格,图像和基于点的配准,椭球拟合,用有效数字舍入,快ROC-AUC
ヒントを与えたファ电子邮箱ル:bin2RTStruct
MultivariableModeling
MultivariableModeling /引导
MultivariableModeling / LogisticRegression
MultivariableModeling /我
MultivariableModeling /公用事业
MultivariableModeling /工具/批处理
MultivariableModeling /工具/ fastAUC
MultivariableModeling /工具/ herrorbar
MultivariableModeling /工具/ roundsd
NonTextureFeatures
研究/ HN_study /功能/ AertsSignature
研究/ HN_study /功能/ BATCH_COMPUTATIONS
研究/ HN_study /功能/ FEATURES_COMPUTATIONS
研究/ HN_study /功能/ FEATURES_COMPUTATIONS /老
研究/ HN_study /功能/ FUSION_PET-CT
研究/ HN_study /功能/ FUSION_PET-CT /老
研究/ HN_study /功能/ MULTIVARIABLE_MODELING
研究/ HN_study /功能/预处理
研究/ HN_study /功能/预处理/ PVEcorrection
研究/ HN_study /功能/预处理/ PVEcorrection /公用事业
研究/ HN_study /功能/预处理/ PVEcorrection /工具/ nonIsotropicGaussianPSF
研究/ HN_study /功能/ READ_DATA
研究/ HN_study /功能/ READ_DATA /档案
研究/ HN_study /功能/ READ_DATA / DICOM_Import
研究/ HN_study /功能/实用工具
研究/ HN_study /功能/工具/ hatchfill2_r7
研究/ HN_study /功能/工具/ kakearney - legendflex pkg - 98 b988e
研究/ HN_study /功能/工具/ kakearney - legendflex pkg - 98 b988e / legendflex
研究/ HN_study /功能/工具/ kakearney - legendflex pkg - 98 b988e / setgetpos_V1.2
研究/ HN_study /功能/工具/ raacampbell-sigstar-9b21ae3
研究/ HN_study /工作区
研究/ LGG_study /功能
研究/ LGG_study /工作区
研究/ STS_study /功能
研究/ STS_study /工作区
TextureToolbox /预处理
TextureToolbox /预处理/正常化
TextureToolbox /预处理/量化
TextureToolbox /预处理/小波
应用灰度共生矩阵建立TextureToolbox /纹理/
TextureToolbox /纹理/ GLRLM
TextureToolbox /纹理/ GLRLM / Wei_Toolbox
TextureToolbox /纹理/ GLSZM
TextureToolbox /纹理/全球
TextureToolbox /纹理/ NGTDM
TextureToolbox /公用事业
公用事业公司
GitHubの既定のブランチを使用するバ,ジョンはダウンロ,ドできません
バ,ジョン | 公開済み | リリ,スノ,ト | |
---|---|---|---|
1.2.0.0 | 更新“描述” |
|
|
1.0.0.0 |
|