主要内容

DimensionalAnalysis

对模型进行量纲分析

描述

的DimensionalAnalysis属性指定在模拟之前是否对模型进行量纲分析。属性的属性CompileOptions对象。CompileOptions对象的对象属性configset对象。当DimensionalAnalysis被设置为真正的, SimBiology®软件检查反应所涉及的单位的物理量和规则是否匹配，是否适用。

例如，考虑一个反应A + b - > c。利用质量作用动力学，将反应速率定义为a * b * k,在那里k为反应的速率常数。如果你指定初始量一个和b分别为0.01M和0.005M，那么单位为k是1 / (M *秒)。如果您指定k例如，用另一个等价的单元定义，1 /((摩尔/升)*秒),DimensionalAnalysis检查物理量是否匹配。如果物理量不匹配，就会看到一个错误，模型没有被模拟。

单位转换需要量纲分析。如果DimensionalAnalysis关了，你又转了UnitConversion上之后,DimensionalAnalysis自动开启。如果UnitConversion是打开的，而你是关闭的DimensionalAnalysis,然后UnitConversion自动关闭。

如果你有MATLAB®函数调用在您的模型中，量纲分析忽略任何包含函数调用的表达式并生成一个警告。

反应速率的有效物理量为量/时间、质量/时间或浓度/时间。

特征

适用于 对象:CompileOptions(在configset对象)
数据类型 布尔
数据值

真正的或假。默认值是真正的。
访问 读/写

请注意

SimBiology允许对任何无量纲的量求幂到任何无量纲的幂。例如，如果两者都有，你可以写下面的表达式x和一个是无量纲的:(x + 3)^(a + 0.5)

请注意

SimBiology使用的单位包括与之关联的空单位DimensionalAnalysis和UnitConversion特性。

  • 当DimensionalAnalysis和UnitConversion都是假，单位不使用。然而，SimBiology仍然执行最低水平的量纲分析，以确定反应速率的维度是量/时间还是浓度/时间。

  • 当DimensionalAnalysis是真正的和UnitConversion是假，单元(如果不为空)必须具有一致的尺寸，以便SimBiology可以进行尺寸分析。但是，单位不会被转换。

  • 当UnitConversion被设置为真正的(需要DimensionalAnalysis是真正的)， SimBiology执行量纲分析，并将所有内容转换为一致的单位。因此，你必须指定一致的单位，任何单位都不能为空。如果你有一个无量纲的参数，你仍然必须将它的单位设置为无量纲的。

提示

如果你有一个自定义功能和UnitConversion开启，请遵循下面的推荐。

  • 非量纲化传递给函数的参数，如果它们不是无量纲的。

    假设您有一个自定义函数定义为y = f (t)在哪里t时间是以小时和为单位吗y是某一种物质的浓度，单位为摩尔/升。例如，当你在模型中使用这个函数来定义一个重复分配规则时，将其定义为:s1 = f(时间/ t0) * s0,在那里时间为模拟时间，t0的参数定义为1.0小时，s0参数定义为1.0 mol /l，和s1是某一种物质的浓度，单位为摩尔/升。请注意,时间和s1不一定要在同一个单位t0和s0，但它们必须在维度上一致。例如,时间和s1单位可以分别设置为分钟和皮摩尔/升。

例子

这个例子展示了如何检索和设置DimensionalAnalysis从默认真正的来假在模型对象中设置的默认配置中。

  1. 导入模型。

    modelObj = sbmlimport (“振荡器”)

    SimBiology模型-振荡器模型组件:模型:0参数:0反应:42规则:0物种:23

  2. 检索configset的模型对象。

    configsetObj = getconfigset(modelObj) Configuration Settings - default (active) SolverType: ode15s StopTime: 10.000000 SolverOptions: AbsoluteTolerance: 1.000000e-006 RelativeTolerance: 1.000000e-003 RuntimeOptions: StatesToLog: all CompileOptions: UnitConversion: true DimensionalAnalysis: true

  3. 检索CompileOptions对象。

    optionsObj =得到(configsetObj,“CompileOptions”编译设置:UnitConversion: true维度分析:true

  4. 赋值为假来DimensionalAnalysis。

    集(optionsObj,“DimensionalAnalysis”假)
Baidu
map