生物信息学工具箱™为下一代测序(NGS)、微阵列分析、质谱分析和基因本体论提供算法和应用程序。使用工具箱功能，您可以从标准文件格式(如SAM、FASTA、CEL和CDF)以及在线数据库(如NCBI基因表达Omnibus和GenBank)中读取基因组和蛋白质组学数据^®．您可以使用序列浏览器、空间热图和集群图来探索和可视化这些数据。该工具箱还提供了用于检测峰值、为缺失数据计算值和选择特征的统计技术。

您可以结合工具箱功能来支持常见的生物信息学工作流程。你可以使用ChIP-Seq数据来识别转录因子;分析RNA-Seq数据，识别差异表达基因;识别微阵列数据中的拷贝数变异和snp;并利用质谱数据对蛋白质图谱进行分类。